رهبر معظم انقلاب، آیتالله خامنهای، در دیدار با برگزارکنندگان همایش بزرگداشت آیتالله میرزا محمدحسین نائینی، این فقیه بزرگ را یک شخصیت استثنایی و از مهمترین ارکان حوزه علمیه نجف معرفی کردند.
به گفته ایشان، آیتالله نائینی در علم اصول، با نوآوریهای فراوان و ساختاردهی دقیق، یک الگو و روش جدید ایجاد کردند. همچنین، تربیت شاگردان برجسته و داشتن دیدگاههای سیاسی پیشرو، از ویژگیهای بارز ایشان بود.
آیتالله خامنهای به کتاب «تنبیه الامه» اشاره کردند و گفتند که این کتاب نشاندهنده تفکر سیاسی آیتالله نائینی در زمینه ضرورت تشکیل حکومت اسلامی بر پایه ولایت و نظارت مردمی است. ایشان تاکید کردند که این دیدگاه، همان مفهوم جمهوری اسلامی است که امروز در ایران پیاده شده است.
رهبر انقلاب همچنین توضیح دادند که حمایت آیتالله نائینی و سایر علمای نجف از مشروطه، در واقع حمایت از برقراری عدالت و پایان دادن به استبداد بود و با سوءاستفادههایی که انگلیسیها از مشروطه در ایران کردند، تفاوت اساسی داشت.

